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2025 CTONG丨SPIRAL双组学共检技术,“突变+甲基化”双引擎开辟液体活检新思路

肿瘤 双组学
昨天 10:13
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在刚刚落幕的第15届中国肿瘤学临床试验发展论坛暨GACT/CTONG 2025年度会议(2025 CTONG)上,燃石医学王国强博士介绍了基于DNA变异和甲基化共检技术(SPIRAL技术)的突破性研究成果,引起参会嘉宾的广泛关注。该技术通过单份样本同步实现基因组与甲基化组检测,在分子残留病灶(MRD)监测、肿瘤辅助诊断及疗效预测等领域带来了显著的突破。



随着临床证据的不断积累,当前液体活检技术在许多临床应用场景取得了一定的研究进展。但不同临床应用场景对液体活检技术有着不同的性能要求,传统液体活检技术聚焦DNA突变,难以兼顾敏感性与特异性。甲基化检测作为液体活检强有力的补充,能够有效赋能复发监测、辅助诊断和疗效评估。因此,燃石医学研发团队将DNA变异和甲基化技术进行整合,创新开发了SPIRAL(Single Portion Input Resourceful Assay of Liquid biopsy)技术,实现“一份样本,双维检测”。

SPIRAL技术降低了样本采集的难度,通过基因组与表观基因组的联合分析,突破了单一维度检测的局限性。在临床应用中,仅需5-30ng的循环肿瘤DNA(cfDNA)投入量,就能同步完成基因组+甲基化组共检测,支持片段组学及UMI纠错,为解决早筛灵敏度不足、MRD 检测精准度有限等临床痛点提供新思路。

目前,研究团队就SPIRAL技术在MRD、癌症辅助诊断、晚期疗效预测方面进行了一些初步探索,并取得了令人满意的成果:


MRD检测

预测复发敏感性大幅提升

MRD检测是评估肿瘤复发风险的关键手段,SPIRAL技术在此领域的表现尤为突出。在结直肠癌细胞系(SW48)和肺癌细胞系(H441)的实验中,该技术能稳定检测出低至 0.02% 的肿瘤丰度,且相关性系数(R=0.99)表明其定量准确性极高。

在术后Landmark MRD检测中,Tumor naïve甲基化联合突变的检测方案将复发预测的敏感性提升至44.8%(单独Tumor naïve突变仅为20.9%),而在Longitudinal监测中,敏感性更是达到60.3%。虽然特异性略有下降,但这种“敏感性优先”的特性对早期复发预警具有重要意义。 


癌症辅助诊断

良恶性疾病诊断更加精准

在BALLOON队列肺癌良恶性鉴别诊断中,SPIRAL 技术通过血浆和肺泡灌洗液的联合分析,展现出优异的性能。以血浆样本为例,甲基化联合突变检测的敏感性达到89.7%,高于单独突变检测的59%;在肺泡灌洗液中,甲基化联合突变后检测敏感性达到100%。

值得注意的是,在肺泡灌洗液样本中,甲基化检测对I期肺癌的敏感性达到100%,而单独突变检测为0%。这一结果表明,SPIRAL技术在早期肿瘤检测中能有效弥补基因突变检测的不足,为肺癌的早诊早治提供了有力工具。未来,随着更多样本的加入,其在早期癌症筛查中的价值或将进一步凸显。


晚期疗效预测

可协助临床免疫治疗分层

在晚期肿瘤治疗中,SPIRAL 技术通过甲基化区域与基因变异的整合分析,发现TERT 等基因变异与甲基化区域的组合特征,可作为免疫联合治疗响应的生物标志物,构建了有效的疗效预测模型。在免疫联合化疗队列中,该模型能显著区分患者的无进展生存期(PFS)和总生存期(OS)(PFS, HR=3.35,P<0.001;OS, HR=2.54, P<0.001),而在化疗组中无显著差异,提示其对免疫治疗获益人群的筛选价值。这些发现为临床医生制定个性化治疗方案提供了重要参考,有助于减少无效治疗带来的医疗负担。

SPIRAL技术通过DNA变异与甲基化的共检创新,在MRD监测、辅助诊断和疗效预测三大临床场景中展现出独特的优势。其高敏感性、多维度分析的特点,能够解决传统检测中“信息单一、样本消耗大”的痛点,提升肿瘤全流程、全周期管理水平。

我们相信,随着后续研究的深入,SPIRAL 技术有望在未来进一步提高肿瘤的早期诊断率、优化治疗方案、改善患者预后,为肿瘤患者带来更多的生存希望。



关于燃石医学

燃石医学(纳斯达克代码:BNR)成立于2014年,公司使命为“用科学守护生命之光”,专注于开发创新可靠、具有临床价值的癌症伴随诊断与早检产品。公司业务及研发方向主要覆盖:1)癌症患病人群精准医学检测;2)全球抗肿瘤药企的生物标志物和伴随诊断合作;3)基于液体活检的多癌种早检。燃石医学于2018年7月获国家药品监督管理局(NMPA)颁发的中国肿瘤NGS检测试剂盒第一证,在体外诊断领域具有里程碑式意义。实验室获得广东省临检中心颁发的 “高通量测序实验室”技术审核,同时获得美国CLIA、CAP和ISO15189实验室质量体系资质认证。公司将继续致力于开发创新可靠的癌症精准检测产品,推动癌症精准医疗领域的发展。


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